轉帖|大數據產品動態|編輯:蔣永|2019-05-09 10:53:13.000|閱讀 248 次
概述:我們的檢索服務中用到了最小編輯距離算法,這個算法本身是平方量級的時間復雜度,并且很少人在帖子中提到小于這個復雜度的算法。但是我無意中發現了另外一個更牛的算法:列劃分算法,使得這個本就很牛的算法性能直接提高一倍。
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我最近一直在慧都大數據部門做檢索性能優化。當我看到這個算法之前,我也不認為我負責的檢索系統性能還有改進的余地。但是這個算法確實太牛掰了,足足讓服務性能提高50%,我不得不和大家分享一下。
說實話,本人數學功底一般,算法證明不是我強項,所以文中的證明只是我在論文作者的基礎上加入了自己的思考方法,并且還沒有完全證明出來,請大家見諒 ! 歡迎愛思考的小伙伴進行補充。我只要達到拋磚引玉的作用,就知足了。
回歸正題,我們的檢索服務中用到了最小編輯距離算法,這個算法本身是平方量級的時間復雜度,并且很少人在帖子中提到小于這個復雜度的算法。但是我無意中發現了另外一個更牛的算法:列劃分算法,使得這個本就很牛的算法性能直接提高一倍。接下來進入正題。
這個算法比較難理解,出自如下論文:《Theoretical and empirical comparisons of approximate string matching algorithms》。In Proceedings of the 3rd Annual Symposium on Combinatorial Pattern Matching, number 664 in Lecture Notes in Computer Science, pages 175~184. Springer-Verlag, 1992。Author:WI Chang ,J Lampe。所以有必要先給大家普及一些共識。
編輯矩陣,最小編輯距離在計算過程中使用動態規劃算法計算的那個矩陣,了解這個算法的都懂,我不贅述。但是我們的編輯矩陣有個特點:第一行都是0,這么做的好處是:只要文本串T中的任意一個子序列與模式串P的編輯距離小于某個固定的數值,就會被發現。
給大伙一個樣例,文本串T=annealing,模式串P=annual:
注意,第一行都是0,這是與傳統最小編輯距離的最大區別,其余的動歸方程完全相同。
對角線法則 編輯矩陣沿著右下方對角線方向數值非遞減,并且至多相差1。
行列法則 每行每列相鄰兩個數至多相差1。
觀察編輯距離矩陣,我們發現如下事實:每一列是由若干段連續數字組成。所以我們把編輯矩陣的每一列劃分成若干連續序列,如下圖所示:
紅色框中就是一個一個的序列,序列內部連續。
序列-δ 定義 對于編輯矩陣的每一個元素D[j][i] (j是行,i是列),若 j - D[j][i] = δ,我們就說D[j][i]屬于i列上的 序列-δ,我們還觀察到隨著j增大,j - D[j][i]是非遞減的。如下圖所示:
序列-δ終止位置 每個序列都會有起始和終止位置。序列-δ的終止位置為j,如果j是序列-δ的最小橫坐標,并且滿足D[j+1][i]屬于序列-ε,并且ε>δ(即j+1-D[j+1][i]>δ)。
長度為0的序列 我們發現如果按照如上定義,每一列上δ的值并不一定連續,總是或有或無的缺少一個數值。所以我們定義長度為0的序列:當D[j+1][i] < D[j][i]時,我們就在序列-δ和序列-(δ+2)之間人為插入一個長度為0的序列-(δ+1)。如下圖所示:
所以,我們按照這個定義,就可以對編輯矩陣的每列進行一個劃分,劃分的每一段都是一串連續數字。
說了這么多,這個定義有什么用呢?假若,我們每次都能根據前一列的列劃分情況直接推導出后一列的列劃分情況,那么就可以省去好多計算,畢竟每一個劃分中的每一段的數字都是連續的,這就暗示我們可以直接用一個常數時間的加法直接得到某一個編輯矩陣的元素值,而不用使用最小編輯距離的動態規劃算法去計算。
接下來的重點來了,我們介紹這個推導公式,請打起十二分精神!我們按照序列-δ長度是否為0來介紹這個推論。由于其中一個推論文字描述太繁瑣,不容易理解,所以我畫了個圖:
接下來燒腦開始。
推論1:如果列i上長度為0的 序列-δ 的結束位置為j,則列i+1上的 序列-δ 的結束位置為 j+1。
證明 :由推論前提我們知道 δ = j - D[j][i] + 1 (想想前面說的δ值不連續,我們就人為插入一個中間值,只不過長度為0)。
我們觀察編輯矩陣就會發現如下兩個事實:
通過事實1,我們知道D[j+1][i+1]確實屬于 序列-δ,因為 j + 1 - D[j+1][i+1] = j + 1 - D[j][i] = δ。
通過事實2,我們知道列i+1上的序列δ,終止位置為j+1。
所以推論1證明結束。
推論2: 文字描述略,請看圖
證明 :
綜上兩點我們得到如下大小關系:D[j-L+1][i+1] >= D[j-L+1][i]。
此外我們知道我們當前列的序列-δ截止位置為j,也意味著D[j+1][i] <= D[j][i],同樣根據對角線法則,我們得出D[j+2][i+1] <= D[j+1][i] + 1 <= D[j][i] + 1。
接下來到了最精彩的一步,我們知道列i當前序列-δ內的值是連續的,如果起始編輯距離為A,那么終止編輯距離為A+L-1。
而由我們的推導可以發現:D[j-L+1][i+1] >= A,D[j+2][i+1] <= (A+L-1) + 1 = A+L,而之間跨越的長度為 (j+2)-(j-L+1)+1= L+2。 我們可以推出列i+1上從行j-L+1到行j+2之間的序列一定不連續,否則D[j+2][i+1] >= A+L+2-1= A+L+1,與我們先前的推導矛盾。所以,在j-L+1和j+2之間一定有一個列終止,這樣才能消去一個序號。
此外我們還有一個疑問,列i+1上的序列-δ結束位置一定在j-L+1和j+1之間么?我們要證明這個事。
證明 :
因為δ=j-D[j][i]=j-L+1-D[j-L+1][i]>=j-L+1-D[j-L+1][i+1],即列i+1上的 序列-δ的結束位置一定在j-L+1或者之后;
由于j+1-D[j+1][i]>δ,根據對角線法則D[j+2][i+1] <= D[j+1][i]+1,有j+2-D[j+2][i+1]>=j+2-(D[j+1][i]+1)=j+1-D[j+1][i] > δ, 固列i+1上的序列-δ的終止位置一定在j+2之前,即j-L+1到j+1之間。
后面推論2的分情況討論,我一個也沒證明出來,作者在論文中輕飄飄的一句話“后面很好證明,他就不去證明了”,但是卻消耗了我所有腦細胞。所以,如果哪位小伙伴把推論2剩下的內容證明出來了,歡迎給我留言,我也學習學習。
這個算法的時間復雜度是多少呢?作者用啟發式的方法證明了算法的復雜度約為O(mn/b√2)O(mn/b2),其中b是字符集大小。
接下來說一下代碼實現,給出我總結出來的步驟,否則很容易踩坑。
接下來做最不愿意做的事:貼一個代碼,很丑。
inline int loc(int find[][200], int *len, int ch, int pos) { for(int i = 0; i < len[ch]; ++i) { if(find[ch][i] >= pos) return find[ch][i]; } return -1; } int new_column_partition(char *p, char *t) { int len_p = strlen(p); int len_t = strlen(t); int find[26][200]; int len[26] = {0}; int part[200]; //記錄每一個序列的結束位置 //生成loc表,用來快速查詢 for(int i = 0; i < len_p; ++i) { find[p[i] - 'a'][len[p[i] - 'a']++] = i + 1; } int pre_cn = 0, next_cn = 1, min_v = len_p; part[0] = len_p; for(int i = 0; i < len_t; ++i) { //前一列partition數 pre_cn = next_cn; next_cn = 0; int l = part[0] + 1; int b = 1; int e = l; int tmp; int tmp_value = 0; int pre_v = part[0]; //前一列第0個partition長度肯定>=1 if(len[t[i] - 'a'] >0 && (tmp = loc(find, len, t[i] - 'a', b)) != -1 && tmp <= e) { part[next_cn++] = tmp - 1; } else if(pre_cn >= 2 && part[1] - part[0] != 0){ part[next_cn++] = part[0] + 1; } else { part[next_cn++] = part[0]; } //每列第一個partition尾值 tmp_value = part[0]; //遍歷前一列剩下的partition for(int j = 1; j < pre_cn && part[next_cn - 1] < len_p; ++j) { int x = part[j], y = pre_v; pre_v = part[j]; l = x - y; if(l == 0) { part[next_cn++] = x + 1; } else { b = x - l + 2; e = x + 1; if(b <= len_p && len[t[i] - 'a'] > 0 && (tmp = loc(find, len, t[i] - 'a', b)) != -1 && tmp <= e) { part[next_cn++] = tmp - 1; } else if(j + 1 < pre_cn && part[j + 1] - x != 0) { part[next_cn++] = x + 1; } else { part[next_cn++] = x; } } l = part[j] - part[j - 1]; if(l == 0) { //新得到的partition長度為0,那么下一個partition的起始值比上一個partition尾值少1 tmp_value -= 1; } else { tmp_value += l - 1; } } if(part[next_cn - 1] != len_p) { part[next_cn++] = len_p; tmp_value += len_p - part[next_cn - 2] - 1; if(tmp_value < min_v) { min_v = tmp_value; } } else { min_v = min_v < tmp_value ? min_v : tmp_value; } } return min_v; }
這個算法應用到線上之后,效果非常明顯,如下對比。
優化前CPU:
優化后CPU:
能力有限,證明不充分,有興趣的小果伴可以直接去看原版論文,歡迎交流,共同進步。
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